实时荧光定量PCR实验操作流程

一、实验器材及试剂

1、 实验器材

  • 多样品研磨珠均质仪

  • 台式高速冷冻型微量离心机

  • 荧光定量PCR仪

  • 超净工作台

  • 分光光度计

  • 离心管

  • TIP头

2、 主要实验试剂及耗材

RNA提取液

三氯甲烷

异丙醇

无水乙醇

HyPure TMMolecular Biology Grade Water

RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit

FastStart Universal SYBR Green Master(Rox)

引物

75%乙醇:HyPure TMMolecular Biology Grade Water配制

离心管、TIP头均购湿热灭菌40min,干燥。


二、荧光定量PCR实验步骤

1、总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶)

1)取匀浆器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上预冷。

2)取100mg组织,加入到匀浆器中。

3)充分研磨直至无可见组织块。

4)12000rpm离心10min取上清。

5)加入250 μl三氯甲烷,颠倒离心管15s,充分混匀,静置3min。

6)4℃ 下12000rpm离心10min。

7)将上清转移到一新的离心管中,加入0.8倍体积的异丙醇,颠倒混匀。

8)-20℃ 放置15min。

9)4℃下12000rpm离心10min,管底的白色沉淀即为RNA。

10)吸除液体,加入75%乙醇1.5ml洗涤沉淀。

11)4℃下12000rpm离心5min。

12)将液体吸除干净,将离心管置于超净台上吹3min。

13)加入15μl无RNA酶的水溶解RNA。

14)55℃ 孵育5min。

15)使用UV1800检测RNA浓度及纯度:仪器空白调零后取2.5μl 待测RNA溶液于检测基座上,放下样品臂,使用电脑上的软件开始吸光值检测。

16)将浓度过高的RNA进行适当比例的稀释,使其终浓度为200ng/μl.左右。

2、反转录(枪头和PCR均经过湿热灭菌,无RNA酶)

1)取一PCR管,加入含2μg RNA的溶液。

2)加入1μl 逆转录引物。

3)用无核糖核酸酶的去离子水补足至12μl。

4)于PCR仪上65℃ 保温5min,迅速置冰上冷却。

5)依次加入4μl  5×buffer,2μl  10mM dNTPs,1μl RNA inhibitor和1μl 反转录酶,用枪抽吸混匀。

6)于PCR仪上42℃保温60min,结束后80℃保温5min灭活反转录酶。

3、定量PCR

1)取0.2ml PCR管,配制如下反应体系,每个反转录产物配制3管。

2× qPCR Mix12.5μl

7.5μM基因引物2.0μl

反转录产物2.5μl

ddH2O8.0μl

2)PCR扩增

预变性95℃,10min

循环(40次)    95℃,15s→60℃,60s

熔解曲线75℃→95℃,每20s升温1℃

4、结果处理

ΔΔCT法:

A=CT(目的基因,待测样本)- CT(内标基因,待测样本)

B=CT(目的基因,对照样本)- CT(内标基因,对照样本)

K=A-B

表达倍数=2-K