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消化系统疾病是影响胃肠道及其消化辅助器官的一类疾病的总称。其中，胃肠道包括食管、胃、小肠、大肠和直肠，消化辅助器官则涵盖肝脏、胆囊与胰腺。肠胃疾病和肝脏疾病是消化系统疾病中的两大核心类别。

胃肠疾病的常见类型包括炎症性疾病、消化性溃疡、肠易激综合征以及消化道癌症（如胃癌、食管癌、结直肠癌等）。炎症发作时会损伤消化道细胞，导致基质蛋白释放至粪便或血清中，通过检测这些生物标志物，可有效评估疾病的进展阶段与严重程度。例如，当胃黏膜发生损伤时，体内胃蛋白酶（PP）和胃泌素释放肽前体（ProGRP）的水平会显著升高。此外，消化系统癌症的发生与慢性炎症、遗传因素密切相关，癌细胞会分泌特定的肿瘤标志物（TM），以此作为提示恶性病变的重要指标。

肝脏疾病主要包括病毒性肝炎、脂肪肝、酒精性肝病、肝硬化和肝癌等。病毒感染、酗酒或代谢异常等因素会造成肝细胞损伤，进而引发炎症、坏死及纤维化等病理改变。肝细胞受损后，会有特定物质释放到血清中，临床可通过检测这些生物标志物来评估肝脏疾病的具体状态。以病毒性肝炎为例，患者血清中的丙氨酸氨基转移酶（ALT）、天冬氨酸氨基转移酶（AST）水平及病毒抗原 / 抗体含量会明显上升。肝癌的发病则与慢性炎症（如乙型 / 丙型肝炎）、遗传因素以及黄曲霉毒素暴露等相关，肝细胞癌细胞会产生甲胎蛋白（AFP）等肿瘤标志物，这些标志物能够直观反映癌症的发展进程。