单抗还是多抗？多肽还是重组蛋白？
我们收到这样一个定制抗体的订单询问，我要定制一个针对小鼠Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein (MOG)某一段序列的抗体，这段序列包含35-55位氨基酸，那么我是需要单克隆抗体好还是多克隆抗体好？制备抗体的时候是用多肽作为免疫原好还是用重组蛋白作为免疫原好呢？
首先，我们来看看单克隆抗体和多克隆抗体的主要区别在哪里呢？单克隆抗体是针对单一抗原决定簇，来自单个B淋巴细胞克隆的抗体，多克隆抗体是针对多个抗原决定簇，由多个B淋巴细胞克隆所产生的抗体。通常来说一个含有多个抗原决定簇的大分子免疫原进入机体后，其不同的抗原决定簇会和带有不同BCR的B细胞进行结合，进而使这些B细胞分化成为多种浆细胞，分泌针对不同抗原决定簇的抗体。这些抗体的集合体就是多抗，而需要得到针对单一抗原决定簇的单抗时，就需要对分泌抗体的B淋巴细胞（实际操作过程中是对融合细胞）进行筛选，并进行单克隆化了。
接下来我们看看实验需求：获得针对35-55位氨基酸的抗体，这个小片段仅包括了21个氨基酸，依据抗原决定簇的大小，该片段内应该仅含有1-2个抗原决定簇，那么由此可以发现客户对于抗体特异性的要求是十分高的，鉴于此，我们建议客户制备单克隆抗体，这样在有限稀释单克隆筛选的过程中就可以直接筛选得到分泌针对目的片段抗体的单克隆株，从而保证特异性。
确定制备何种抗体后，我们就需要确定该用什么免疫原了。小鼠MOG蛋白是一个含有246个氨基酸的跨膜蛋白，仅从蛋白大小来分析，其至少还有10-20个抗原决定簇。姑且不论跨膜蛋白不易表达，即使我们能表达出全长的蛋白，如果我们用该蛋白作为免疫原免疫动物制备抗体，再从针对不同的抗原决定簇的抗体中筛选出仅针对35-55位氨基酸的抗体，那么特异性抗体筛选的工作量和实验用时无疑是很大的，鉴于此，可以考虑直接用多肽进行载体偶联后作为免疫原来制备抗体。
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