miRNA-mRNA形成的功能环或将成为小分子药物发现的潜在靶点
2020年5月28日，来自南方医科大学的Aiping Lu教授，香港浸会大学的Ge Zhang教授和香港中文大学的Bao-Ting Zhang教授联合发表了题为：“A Loop-Based and AGO-Incorporated Virtual Screening Model Targeting AGO-Mediated miRNA–mRNA Interactions for Drug Discovery to Rescue Bone Phenotype in Genetically Modified Mice”的文章。研究建立了一种基于miRNA-mRNA形成的loop和AGO蛋白的虚拟筛选模型。通过虚拟模型，分别选择前10个候选miR-214-ATF4 mRNA相互作用小分子和前10个候选miR-214-TRAF3 mRNA相互作用小分子。体外和体内数据显示，一个小分子靶向miR-214-ATF4 mRNA促进ATF4蛋白表达，增强成骨潜能，而另一个小分子靶向miR-214-TRAF3 mRNA促进TRAF3蛋白表达，抑制破骨细胞活性。这些数据表明，基于loop和AGO蛋白的虚拟筛选模型可以筛选得到与miRNA-mRNA相互作用的小分子。
在这篇文章中，云克隆ELISA试剂盒（Ⅰ型胶原交联羧基端肽（Cross Linked C-Telopeptide Of Type I Collagen, CTX1）kits，CEA665Mu）再次受到了科研工作者们的认可。
产品：Ⅰ型胶原交联羧基端肽 ELISA Kit
货号：CEA665Mu
实验方法：竞争抑制
检测范围：39.06-10,000pg/mL
研究介绍：
MicroRNA是内源性单链非编码RNA，它调控着上百条基因的表达并在一系列的生理生化过程中扮演重要角色。近来，有研究提出Inforna法筛选小分子互作的靶向RNA。然而，因为一个miRNA可以调控许多种靶向mRNA，所以 Inforna法针对靶向pri-miRNA（Primary miRNA, pri-miRNA）的筛选缺乏针对性。
成熟miRNA及其特异性靶向mRNA在Argonaute（AGO）蛋白介导的miRNA-mRNA相互作用中形成独特的功能环，可能成为小分子药物发现的潜在靶点。我们的研究进一步表明这种环状结构具有结构独特性、功能重要性、高稳定性和高特异性。因此，可以假设miRNA与其靶mRNA形成的环作为药物发现的靶点。此外，由于miRNA-mRNA构象的改变可能导致AGO的裂解活性改变，研究进一步计算了虚拟模型中候选小分子结合前后的AGO-miRNA-mRNA复合物的能量变化，以提高筛选准确性。
此外，之前发表的研究发现miR-214可以与ATF4靶向结合抑制成骨形成，与TRAF3靶向结合促进破骨细胞活性。因此，基于算法分别筛选出10个可能与miRNA-214-ATF和miRNA-214-TRAF3相互作用的小分子，用biotin标记的miRNA-214与小分子进行体外培养，LC-MS检测发现有4个预测与ATF互作的小分子和3个与TRAF3互作的小分子能检测到信号。使用MC3T3-E1和RAW264.7细胞种过表达miR-214，之后分别于筛选出的小分子结合，发现1个与ATF互作的小分子和1个与TRAF3互作的小分子可以高度结合AGO2。最后对这两个小分子进行验证实验以证明该筛选模型的有效性。
